רשות ניקוז שקמה בשור הציבה לה מספר יעדים מרכזיים

1.  להגן על תושבי הדרום מפני שטפונות והצפות.
2. הסדרה וביצוע פעולות תחזוקה בנחלים על מנת לאפשר זרימה חופשית.
3. לשקם ולהסדיר את המחצבות ואתרי הכרייה בנחלים.
4. להעלות את נושא הנחלים לסדר היום הציבורי ולתודעת הציבור.
5. לקחת חלק פעיל במוסדות התכנון במטרה לשמור על הנחלים ולמנוע חסימה, והסטה של נחלים.
6. לתכנן ולפתח פארקים וטיילות לאורך ערוצי נחלים.
7. לרכז את כל הסמכויות שקשורות לנחלים בגוף אחד. לדוגמא- רשות נחל ורשות לשימור קרקע.